Ha aparecido una actualización de Bio-Linux 8, una distribución de origen británico, basada en Ubuntu 14.04 LTS y enfocada a realizar tareas de bioinformática.
Bio-Linux 8 es una plataforma para estaciones de trabajo enfocada a la bioinformática que incluye más de 250 programas relacionados con la disciplina. Incorpora el entorno Galaxy que ofrece una interfaz basada en el navegador para el análisis de datos.
El equipo de desarrollo pone a disposición de los usuarios imágenes preparadas para ser ejecutadas en máquinas virtuales como VirtualBox, VMWare o Parallels.
Bio-Linux 8 es la versión mayor que se actualiza en esta ocasión y sus principales características son las siguientes:
· Está basada en Ubuntu 14.04 por lo que la mayoría del software incluido viene con las versiones de esta edición.
· Se incluyen versiones actualizadas de programas enfocados a la bioinformática como QIIME, Mothur, Jalview, Artemis, BLAST, Bowtie-BIO y otras muchas.
· Además se incorporan algunos paquetes de R actualizados, incluyendo ggplot2, DESeq y edgeR.
· Se usa x2go en vez de NX como servidor de escritorio remoto.
· Existe la opción de elegir MATE como alternativa ligera de Unity.
· El empaquetado de Galaxy se ha mejorado y ahora tiene soporte para proxy de Apache, configuración automática de PostgreSQL y servidor SFTP entre otras.
Con esta revisión recién salida del horno, se han producido los siguientes cambios:
· Se ha solucionado un problema que había a la hora de iniciar el escritorio en VirtualBox debido a un fallo con los controladores.
· Se han actualizado varios paquetes como QIIME y las utilidades Bowtie-Bio.
· Se incluye nueva documentación.
Para saber más de Bio-Linux 8, puedes visitar su página oficial. La información de Bio-Linux 8.0.5 está disponible en la lista de correo del proyecto. Por último, la nueva ISO se puede descarga desde aquí.